yl60000永利官网曾红丽副教授与瑞典皇家理工大学Erik Aurell教授、瑞典哥德堡大学Kaisa Thorell副研究员、古巴哈瓦那大学Edwin Rodriguez Hortae博士及意大利的里雅斯特大学Vito Dichio合作，在新型冠状病毒SARS-CoV-2基因序列分析方面取得重要进展。该成果以yl60000永利官网为第一完成单位，于2020年11月17日在线发表于国际权威期刊美国科学院院刊（PNAS）上。
该研究工作从系统生物学和统计物理学角度出发，在GISAID数据库中截至4个不同时间节点的所有完整SARS-CoV-2基因序列基础上，将新型冠状病毒的大约3万个基因位点浓缩为存在显著相互影响的8个基因位点对。研究从系统生物演化的准连锁平衡假设出发，采用统计物理学中发展的反珀兹（Potts）模型（生物界称之为“直接耦合分析(DCA)”方法），利用多态基因位点推断病毒基因位点在演化过程中的上位性/适应性。
研究结果表明，存在上位性的八个基因位点中（ORF3a和nsp2，nsp12和nsp6，ORF8和nsp4，以及基因nsp2，nsp13和nsp14），位于ORF3a和nsp2基因片段上的两个位点均为非同义突变，位于nsp13基因片段中的两个位点之间同样存在非同义突变。
本研究工作以基因位点对之间较强的上位性为起点，为寻找病毒病原体结合和重组过程中存在的弱点带来了希望，对开发临床治疗的综合靶向药物、研究病毒进入宿主后的发病机制有着很强的生物医学指导意义。
此项工作受到国家自然科学基金委（基金号11705097）和江苏省科学技术厅（基金号BK20170895）的大力支持。